Dr.Eman Alshehri

  Data Scientists-  DNA and RNA sequencing

Mapping of short-read data against a reference genome 

 Alignments, De novo genome and transcriptome assembly

  Library preparation, variant calling and detections (SNPs)

Genomic Viewers using different  tool (Artemis, IGV)

Gene annotations, the mostly on a Linux-based OS

  Large scale biological data

Programming languages; Perl and Python for performing wide range of data

علماء البيانات – تسلسل الحمض النووي (DNA) والحمض النووي الريبي (RNA)

• إجراء تسلسل الحمض النووي (DNA) والحمض النووي الريبي (RNA).
• مواءمة بيانات القراءات القصيرة مع الجينوم المرجعي.
• تحليل محاذاة التسلسلات، وتجميع الجينوم والترانسكريبتوم من الصفر (De novo).
• تحضير المكتبات الجينية، واستدعاء المتغيرات الجينية والكشف عنها، بما في ذلك تعدد أشكال النيوكليوتيدات المفردة (SNPs).
• استخدام أدوات عرض الجينوم المختلفة، مثل Artemis وIGV.
• إجراء التعليقات التوضيحية الجينية (Gene Annotation)، غالبًا باستخدام أنظمة تشغيل قائمة على Linux.
• تحليل البيانات البيولوجية واسعة النطاق.
• استخدام لغات البرمجة Perl وPython لمعالجة البيانات البيولوجية وتنفيذ مجموعة واسعة من مهام التحليل الحيوي.